В организм животного лептоспиры проникают через незначительные повреждения кожи и неповрежденные слизистые оболочки полости рта, носа, глаз, желудочно-кишечного и мочеполового трактов. Основной путь передачи инфекции – через воду, меньшее значение имеют контактный и пищевой. Проникнув в организм здорового животного, лептоспиры не вызывают изменений на месте проникновения, благодаря активной подвижности быстро попадают в кровяное русло, где их количество на протяжении периода болезни увеличивается. Продолжительность этого периода по разным данным колеблется от 2 до 14 дней. Характер инфекционного процесса даже в популяции животных одного вида может варьировать от бессимптомной инфекции до тяжелой болезни, что связано с количеством и вирулентностью возбудителя, серовариантной принадлежностью инфицировать данный вид животных, способом инфицирования.
Наиболее характерные клинические признаки это конъюнктивиты, геморрагии (кровоизлияния) на слизистых оболочках, мышечная слабость, депрессия. В тяжелых случаях отмечают нефриты и дегенерацию почек, а иногда гематурию (наличие крови в моче) и желтушность слизистых оболочек, периодическое воспаление глаз (увеит).
Из кровяного русла лептоспиры проникают во внутренние печень, почки, селезенку, матку, развивающийся плод, спинномозговую жидкость, глаза. У части животных процесс размножения и накопления лептоспир в крови сопровождается лихорадкой, как правило, кратковременной. Из кровяного русла с появлением специфических антител лептоспиры проникают в почки, где они недоступны разрушающему действию антител, активно размножаются и в дальнейшем выделяются с мочой, инфицируя окружающую среду, корма.
Лептоспиры вызывают аборты, рождение мертвого или нежизнеспособного плода. Продолжительность лептоспироносительства составляет от нескольких месяцев до 2 и более лет.
В целях профилактики заболевания животных вакцинируют.