АлтГУ начал уникальное исследование генома

АлтГУ начал уникальное исследование генома
Фото: www.amic.ru
Это стало возможным благодаря приобретению редкого для Сибири прибора секвенирования

Ученые опорного Алтайского государственного университета приступили к исследованиям в области полногеномного секвенирования с помощью уникальной технологии нанопорового секвенирования. На территории всей Сибири подобных систем  пока насчитываются единицы.

Полногеномный секвенатор нового поколения MinIon компании OxfordNanopore способен расшифровать последовательность ДНК и РНК практически у любого организма. Южно-Сибирский ботанический сад опорного вуза приобрел данное оборудование летом 2018 года и приступил к исследовательской работе на нем с начала осени.

Младший научный сотрудник Южно-Сибирского ботанического сада АлтГУ Михаил  Скапцов сейчас непосредственно работает на секвенаторе  в рамках сразу нескольких проектов.

Так, например,  он проводит полногеномное секвенирование костей древних домашних животных, найденных археологами АлтГУ в рамках проекта под руководством профессора Алексея  Тишкина, в результате которого будет установлена история становления домашних пород животных.

Другой проект, поддержанный Российским фондом фундаментальных исследований совместно с Государственным фондом естественных наук Китая, исследует эволюцию двух групп древнейших растений семейства плауновых с последующим прогнозированием процессов эволюции в похожих группах растений. 

"В рамках проекта "Таксономия комплекса Selaginella sanguinolenta и S. helvetica", руководителем которого выступил директор Южно-Сибирского ботанического сада,  профессор Александр Шмаков, мы исследуем микроэволюционные процессы растений и их влияние на геном. То есть мы планируем выяснить, что происходит с геномом при дивергенции видов, расхождении признаков при параллельной эволюции, —  пояснил Михаил Скапцов. —  С помощью секвенатора мы оцениваем влияние микроэволюционных процессов на геном растения. Данный прибор позволяет анализировать полностью геном растения, а на основе полученных данных оценить, что с ним могло произойти за сотни и тысячи лет  в случаях полиплоидии, наследственных изменений, гибридизации и так далее. Соответственно, мы можем оценить сходство данных растений  на уровне их геномов: какие гены включились или выключились, почему впоследствии произошло то  или иное морфологическое изменение".

Кстати, методика секвенирования ДНК была использована шведским ученым Сванте Пеэбэ, основателем палеогенетики, для реконструкции  ДНК, извлечённой из фрагмента кости, которая была найдена в  Денисовой пещере   на Алтае. В итоге ученые констатировали  существование в древности ранее неизвестного вида гоминид  —  денисовского человека .

Ещё новости о событии:

АлтГУ начал уникальное исследование генома - ИА Амител
Это стало возможным благодаря приобретению редкого для Сибири прибора секвенирования Ученые опорного Алтайского государственного университета приступили к исследованиям в области полногеномного секвенирования с помощь
13:24 08.11.2018 ИА Амител - Барнаул
Ученые Алтайского государственного университета приступили к исследованиям в области полногеномного секвенирования с помощью уникальной технологии нанопорового секвенирования.
17:51 07.11.2018 АлтГУ - Барнаул
 
По теме
Алтайский филиал Президентской академии приглашает студентов вузов 2-5 курсов к участию во Всероссийском конкурсе научных работ по статистике и предиктивной аналитике.
Пропуск талых вод  в Хабарском районе - Газета Вестник целины В весенний период пропуска паводковых вод в населённых пунктах Хабарского района, при увеличении уровня воды в реке Бурла, может происходить подтопление жилых домов и надворных построек.
Газета Вестник целины
Эвакуация в барнаульском ТЦ/ Фото: Екатерина Смолихина - ИА Амител Правоохранительные органы разыскивают распространителей фейков В соцсетях и мессенджерах распространяются сообщения о готовящихся нападениях на крупные торговые центры Барнаула в начале апреля.
ИА Амител
Здоровье: сохранить и преумножить! - Министерство здравоохранения Профилактические осмотры и диспансеризация позволяют выявить на ранней стадии многие неинфекционные хронические заболевания, борьба с которыми предусмотрена рамках национального проекта «Здравоохранение».
Министерство здравоохранения